研究报告/Research Report

甘蔗印度种响应干旱胁迫的数字基因表达谱  

李穆1,2 , 程志远1,3 , 何丽莲1 , 王先宏1 , 李富生1
1云南农业大学农学与生物技术学院, 昆明, 650201;
2广西壮族自治区亚热带作物研究所, 南宁, 530001;
3中国农业科学院作物科学研究所, 北京, 100081
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2017年06月18日    接受日期: 2017年08月29日    发表日期: 2018年05月22日
© 2018 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘要

本研究以甘蔗印度种的代表品种“春尼”为试材,采用数字基因表达谱(DGE)技术对干旱胁迫后的“春尼”进行差异基因表达分析,共筛选到差异表达基因9 810个,其中上调表达4 687个,下调表达5 123个。GO功能显著性富集分析表明:差异表达基因主要定位于细胞质、质体、叶绿体、类囊体等,主要行使催化活性、氧化还原酶活性、辅因子结合、裂解酶活性等功能,主要涉及小分子代谢、细胞酮体代谢、有机酸代谢、含氧酸代谢、化学刺激应答、非生物刺激应答等生物过程。KEGG显著性富集分析表明:差异表达基因主要涉及植物激素信号转导、RNA转运、次生代谢产物的生物合成、淀粉和蔗糖代谢、泛素化蛋白降解、嘌呤碱代谢等通路。利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析2个差异表达上调基因在“春尼”的苗期、伸长期、成熟期受干旱诱导的表达情况,结果均为“上调-上调-上调”模式,验证了DGE测序结果可靠、重复性好。

关键词
甘蔗印度种;春尼;干旱; 数字基因表达谱; 差异表达基因

HTML格式版本正在制作中。
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
李穆
.
程志远
.
何丽莲
.
王先宏
.
李富生
相关论文
.
甘蔗印度种
.
春尼
.
干旱
.
数字基因表达谱
.
差异表达基因
服务
. 发表评论